La première saison (numérotée « BU » et nommée La préhistoire dans l'édition VHS) comprend cinquante-deux épisodes de deux minutes chacun, en 35 mm couleur. Réalisée en 1968, c'est la seule qui a utilisé l'animographe. Elle est diffusée à partir du 29 avril de la même année, mais est interrompue lors des événements de mai 68, puis reprend au mois de septembre.
C'est ici que l'on trouve une grande partie des bases de la logique Shadok, et que sont présentés les personnages principaux. Pendant toute la saison (ou presque), les Shadoks tenteront de se rendre sur la Terre, sans succès avant la toute fin, dans des tentatives relativement répétitives.
Épisode 1
Sur la planète Gibi vivent les Gibis. Sur la planète Shadok vivent les Shadoks. Les deux peuples ont des difficultés à vivre sur leurs planètes respectives et décident d'aller sur la Terre.
Épisode 2
Les Shadoks et les Gibis qui vivent sur leurs planètes respectives ont décidé d'aller sur la Terre. Les Shadoks ressemblent à des oiseaux : ils pondent des oeufs mais ont des ailes ridiculement petites.
Épisode 3
Les Shadoks et les Gibis qui vivent sur leurs planètes respectives ont décidé d'aller sur la Terre. Les Gibis portent des chapeaux, sont très intelligents et produisent du cosmogol 999 pour alimenter leur fusée en carburant.
Épisode 4
Les Shadoks et les Gibis qui vivent sur leurs planètes respectives ont décidé d'aller sur la Terre. Les Shadoks essaient de construire une fusée interplanétaire sous la direction du professeur Shadoko pour y arriver avant les Gibis.
Épisode 5
Épisode 6
Épisode 7
Épisode 8
Épisode 9
Épisode 10
Épisode 11
Épisode 12
Épisode 13
Épisode 14
Épisode 15
Épisode 16
Épisode 17
Épisode 18
Épisode 19
Épisode 20
Épisode 21
Épisode 22
Épisode 23
Épisode 24
Épisode 25
Épisode 26
Épisode 27
Épisode 28
Épisode 29
Épisode 30
Épisode 31
Épisode 32
Épisode 33
Épisode 34
Épisode 35
Épisode 36
Épisode 37
Épisode 38
Épisode 39
Épisode 40
Épisode 41
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Épisode 51
Épisode 52